| 学院 | 系科名称 | 招生专业名称 |
| 少年班学院 | 少年班 | 少年班 |
| 创新试点班 | 创新试点班 | |
| 教学改革试点班 | 理科试验班类 | |
| 数学科学学院 | 数学系 | 数学类 |
| 物理学院 | 物理系 | 物理学类 |
| 近代物理系 | ||
| 光学与光学工程系 | ||
| 天文学系 | ||
| 化学与材料科学学院 | 化学系 | 化学类 |
| 化学物理系 | ||
| 材料科学与工程系 | 材料科学类 | |
| 高分子科学与工程系 | ||
| 生命科学学院 | 分子生物学与细胞生物学系 | 生命科学与技术基地班 |
| 神经生物学与生物物理学系 | ||
| 系统生物学系 | ||
| 医药生物技术系 | ||
| 工程科学学院 | 近代力学系 | 力学类 |
| 精密机械与精密仪器系 | 机械设计制造及其自动化 | |
| 热科学和能源工程系 | 热能与动力工程 | |
| 安全科学与工程系 | 安全工程 | |
| 信息科学技术学院 | 电子工程与信息科学系 | 电子信息科学类 |
